森林では毎年繰り返し地表に降り積もる落ち葉や枯れ木・枯れ草などを、主にキノコ菌が分解し、それらが多様な土壌微生物間で循環利用されることで清浄で豊かな土壌生態系を作り出しています。

　森林の多様な土壌微生物が作り出す代謝生産物は、森の木々に利用され、活力を与えていると想像されます。それは最近、急激に研究が進み、話題となっている腸内フローラ（腸内の微生物群）が人の健康に大きく関係しているのと同じだと考えると理解できます。

　また、森林の清浄な土壌には菌根菌などの根部エンドファイトと呼ばれる菌類がたくさん存在し、木や草の根と共生していることが知られています。 これらの菌類は、土壌深部まで菌糸を伸ばし、地中から養分やミネラルを植物に供給するものや、病原菌の侵入をおさえるものがあります。

　最近では、ほぼ全ての植物がそれぞれの種や個体と相性の良い根部エンドファイトと共生できることがわかってきました。

　植物と菌根菌などの菌類との共生の歴史は、はるか数億年前、根のない水生植物に土壌菌が共生することで根の代わりとなり、陸上に生活圏を広げたという説もあります。

　根部エンドファイトを始め、多様な土壌微生物は森林の清浄な土壌にはたくさん存在しますが、化学農薬や化学肥料を多用して、土作りを怠っている農地にはほとんど存在しておらず、これらの土壌微生物の農業分野での活用が期待されています。

​　野菜の風味や栄養は、土壌環境によって変化します。例えば山菜の豊かな風味は、自然な土壌環境で育まれていますが、畑で肥料を与えて育てると本来の風味を失います。豊かで清浄な土壌環境の中に根を伸ばし、肥料を与えることなく微生物と共生して育った作物は、山菜と同じように、その作物本来の風味を取り戻し、健やかに育ちます。

　「自然農園 森の土」では、もみがらや刈草、廃菌床（キノコを栽培した後の培地、森の土では新潟県産杉おがこと米ぬかで作られた廃菌床を土作りの最初の段階で活用）などを使い、キノコが生える清浄な土壌を育み、様々な菌類との共生により野菜や果物が健康で風味豊かに育つ環境を整える森の土独自の自然栽培に取り組んでいます。　

　肥料 農薬 除草剤を使わず、清浄な「森の土」を畑に再現することで、あらゆる野菜が健康で美しくおいしく育つ環境づくりをするために、たくさんの時間と手間をかけています。

　周囲の「無謀」という声をよそに、松林になっていた海岸砂丘の耕作放棄地の松を切り倒し、ノイバラを引き抜き、アンズ、ウメ、スモモ、プラム、アーモンド、モモ、リンゴ、ブドウ、などの苗木を植えて、農薬、肥料、除草剤を使わない「奇跡の果樹園」の造成に取り組んでいます。